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中小板与新三板同属中国多层次资本市场，但两者定位与现状截然不同。
中小板全称为“中小企业板”，由深圳证券交易所于 2004 年设立，旨在服务规模较小但成长性较高的中小企业。2021 年 4 月 6 日，深交所主板与中小板正式合并，中小板不再作为独立板块存在。合并后，原中小板上市公司股票代码（002 开头）及简称保持不变，交易规则与深市主板完全一致，其定位已完全融入主板市场。
新三板全称为“全国中小企业股份转让系统”，2013 年正式运营，目前依然独立运行。它属于场外市场，主要服务于创新型、创业型及成长型中小微企业。与主板相比，新三板准入门槛较低，但对个人投资者设有较高的资产与经验要求。目前新三板实行分层管理，分为基础层和创新层。原有的精选层已于 2021 年平移至北京证券交易所（北交所），成为独立的证券交易所市场。
总体而言，中小板已完成历史使命并入主板，而新三板作为中小微企业的融资平台及北交所的“蓄水池”，依然在资本市场中发挥着重要作用。
“新三板”这个名字，其实是一个相对概念，它的由来主要包含两层历史逻辑：
1. 为了区别于承接退市公司的“老三板”
在 2006 年之前，中国资本市场存在一个被称为“老三板”的市场（官方名称为“代办股份转让系统”）。这个市场主要用来处理历史遗留的法人股，以及从沪深交易所退市公司的股份转让。因为里面大多是退市企业，交易非常冷清，被市场俗称为“老三板”。
2006 年，为了给中关村科技园区的优质非上市高新技术企业提供融资渠道，监管层在原有的代办股份转让系统内增设了一个新的试点。因为这个新试点里装的是充满活力的科技型企业，与老三板里那些退市公司有着本质区别，为了加以区分，市场便形象地将其称为“新三板”。
2. 代表继沪深交易所之后的“第三家全国性证券交易场所”
在中国的资本市场语境中，主板和中小板常被称为“一板”，创业板被称为“二板”。而新三板作为独立于沪深交易所之外的场外市场，自然被归为“三板”的范畴。
随着 2013 年新三板正式扩容至全国，以及后续法律地位的明确，它正式成为继上海证券交易所、深圳证券交易所之后，经国务院批准设立的第三家全国性证券交易场所。
所以，“新三板”这个名字，既记录了它从“老三板”中脱胎换骨的历史渊源，也确立了它在中国多层次资本市场中“第三极”的重要地位。
新三板的运营机构——全国中小企业股份转让系统有限责任公司，位于北京市，具体地址为北京市西城区金融大街丁 26 号，这正是北京证券交易所（北交所）的经营地址。
回顾其发展历程，新三板最早起源于 2006 年北京中关村科技园区的试点。2013 年 1 月 16 日，全国中小企业股份转让系统在北京金融街正式揭牌运营。
因此，无论是从历史起源还是当前的实际运营来看，新三板都扎根于北京。
